مع مرور الزمن حاولت أسر الصين التحرر من الاستعمار التتري لهم، ونجحت أسرة منغ في الانقلاب على السلطة، وأبقت المسلمين في أماكن قيادتهم للدولة، وضرب المسلمون مثلا رائعا في التعايش السلمي مع غير المسلمين، حتى سقوط أسرة منغ الصينية في 1052هـ، وحلّ محلها أسرة مانشو، وبدأ اضطهاد المسلمين في الصين على أيدي الأسرة المانشورية، كما احتلت تركستان وجعلت عليها حاكما من عملائها وغيرت التركستان إلى سينجيانغ، حتى سقوط دولتهم وقيام الحكم الجمهوري في الصين
